Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zbtb38Q3LR78 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zbtb38Q3LR78 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zbtb38Q3LR78 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zbtb38Q3LR78 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbtb38Q3LR78 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms