Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gbp8Q2V6D6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms