Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam171bQ14CH0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms