Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc162pQ0VG85 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms