Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttc39dQ0VF76 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Ttc39dQ0VF76 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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