Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samd12Q0VE29 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd12Q0VE29 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms