Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms