Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms