Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf541Q0GGX2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms