Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms