Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rbp2Q08652 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms