Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms