Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms