Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms