Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn6Q03958 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pfdn6Q03958 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pfdn6Q03958 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pfdn6Q03958 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn6Q03958 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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