Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms