Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms