Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeleQ00690 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms