Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms