Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms