Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmsP97355 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmsP97355 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmsP97355 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmsP97355 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmsP97355 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms