Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfbiP82198 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms