Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms