Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SbdsP70122 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms