Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gabra1P62812 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms