Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap25P60879 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap25P60879 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms