Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms