Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csrnp3P59055 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms