Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P58686 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P58686 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms