Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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