Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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