Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms