Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp1P55194 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3bp1P55194 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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