Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Aqp4P55088 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms