Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23aP54726 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms