Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Fgf9P54130 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fgf9P54130 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fgf9P54130 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms