Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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