Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbrP50284 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms