Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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