Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtpreP49446 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtpreP49446 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpreP49446 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtpreP49446 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtpreP49446 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpreP49446 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpreP49446 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpreP49446 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpreP49446 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpreP49446 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpreP49446 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpreP49446 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpreP49446 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpreP49446 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpreP49446 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtpreP49446 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpreP49446 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpreP49446 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpreP49446 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpreP49446 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtpreP49446 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpreP49446 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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