Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VdrP48281 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VdrP48281 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VdrP48281 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VdrP48281 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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VdrP48281 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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