Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf1P39428 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms