Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grin1P35438 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms