Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms