Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc11P31313 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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