Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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