Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa3P28310 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms