Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gjb1P28230 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gjb1P28230 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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