Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U2af2P26369 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U2af2P26369 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms