Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CftrP26361 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CftrP26361 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms